MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 1842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019942	T	6	6	1163472	1163477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_019942	TAA	2	6	1176079	1176084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_019942	ATTTT	2	10	1176309	1176318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_019942	A	6	6	1176338	1176343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019942	TA	3	6	1176346	1176351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019942	TCT	2	6	1178098	1178103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_019942	TTA	2	6	1182678	1182683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019942	TTA	2	6	1182687	1182692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019942	C	6	6	1183931	1183936	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1510	NC_019942	AATT	2	8	1186556	1186563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019942	A	6	6	1186575	1186580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019942	ACC	2	6	1192738	1192743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_019942	CCT	2	6	1193118	1193123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_019942	AAT	2	6	1193169	1193174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_019942	A	6	6	1193180	1193185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_019942	AT	3	6	1194256	1194261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_019942	TA	3	6	1194279	1194284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_019942	GGA	2	6	1195593	1195598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_019942	A	6	6	1200435	1200440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_019942	TATT	2	8	1201279	1201286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_019942	T	9	9	1201285	1201293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_019942	TATT	2	8	1201328	1201335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_019942	TAGGG	2	10	1201363	1201372	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_019942	TCCCGG	2	12	1201414	1201425	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_019942	A	6	6	1203592	1203597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_019942	GAAA	2	8	1203599	1203606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_019942	GAA	2	6	1203627	1203632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_019942	ATTT	2	8	1214236	1214243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019942	TA	3	6	1214261	1214266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_019942	GAA	2	6	1214267	1214272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_019942	TGG	2	6	1214288	1214293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_019942	T	6	6	1215652	1215657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_019942	A	7	7	1215664	1215670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_019942	T	6	6	1217062	1217067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_019942	GCA	2	6	1217083	1217088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_019942	TAAA	2	8	1217157	1217164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019942	AGC	2	6	1217166	1217171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_019942	GGA	2	6	1217176	1217181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019942	GCT	2	6	1217245	1217250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_019942	AAT	2	6	1217372	1217377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019942	AAG	2	6	1217405	1217410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_019942	TAT	2	6	1219528	1219533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019942	ATT	2	6	1219564	1219569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019942	TAA	2	6	1219671	1219676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_019942	TAAAA	2	10	1219680	1219689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_019942	GGA	2	6	1229526	1229531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_019942	CAC	2	6	1229576	1229581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_019942	GAA	2	6	1229660	1229665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_019942	AAAT	2	8	1230102	1230109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_019942	AT	3	6	1230108	1230113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_019942	TAA	3	9	1230118	1230126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_019942	TA	3	6	1230194	1230199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_019942	GAT	2	6	1230233	1230238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_019942	CTT	2	6	1230775	1230780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_019942	TCA	2	6	1230789	1230794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_019942	TA	4	8	1230819	1230826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_019942	TAC	2	6	1230940	1230945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_019942	CCAA	2	8	1230948	1230955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_019942	TAC	2	6	1231026	1231031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_019942	TA	3	6	1231072	1231077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019942	A	6	6	1231131	1231136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_019942	A	6	6	1231248	1231253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019942	TAAAAA	2	12	1231305	1231316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019942	ATT	2	6	1231399	1231404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_019942	ATA	2	6	1231534	1231539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_019942	GAT	2	6	1231566	1231571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_019942	GGT	2	6	1231618	1231623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_019942	TCC	2	6	1231629	1231634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_019942	T	6	6	1231760	1231765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_019942	T	6	6	1234879	1234884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_019942	ATA	2	6	1234907	1234912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_019942	ATT	2	6	1237954	1237959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_019942	TAAAAA	2	12	1237978	1237989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_019942	A	8	8	1237985	1237992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_019942	CACT	2	8	1238588	1238595	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_019942	AGG	2	6	1238666	1238671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_019942	TGG	2	6	1238712	1238717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019942	GCC	2	6	1238757	1238762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_019942	T	6	6	1238819	1238824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_019942	CTT	2	6	1238831	1238836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_019942	GCCG	2	8	1238841	1238848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_019942	CTA	2	6	1238856	1238861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_019942	CGG	2	6	1238867	1238872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_019942	A	6	6	1239866	1239871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_019942	AG	3	6	1239888	1239893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_019942	TA	3	6	1240728	1240733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_019942	ATA	2	6	1241677	1241682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_019942	ATTT	2	8	1241712	1241719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_019942	AAT	2	6	1241795	1241800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019942	TA	3	6	1241810	1241815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_019942	CAA	2	6	1241840	1241845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_019942	AAT	2	6	1246077	1246082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_019942	AT	4	8	1246094	1246101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_019942	GCT	2	6	1246177	1246182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_019942	TC	3	6	1246236	1246241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_019942	GTC	2	6	1246278	1246283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_019942	CGG	2	6	1246390	1246395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_019942	TGG	2	6	1246544	1246549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_019942	ACC	2	6	1246558	1246563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_019942	ACG	2	6	1246570	1246575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_019942	GCA	2	6	1246642	1246647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_019942	CGA	2	6	1246678	1246683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_019942	CCTT	2	8	1246699	1246706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_019942	GCC	2	6	1246770	1246775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_019942	GTG	2	6	1246797	1246802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_019942	TAT	2	6	1246808	1246813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_019942	GGGGTA	2	12	1246931	1246942	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_019942	G	6	6	1246958	1246963	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_019942	ACC	2	6	1246964	1246969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_019942	GAG	2	6	1247196	1247201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_019942	GAC	2	6	1247269	1247274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_019942	GGT	2	6	1247298	1247303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_019942	CGAG	2	8	1247354	1247361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_019942	CG	3	6	1247486	1247491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_019942	CCGT	2	8	1247548	1247555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_019942	GTA	2	6	1247601	1247606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_019942	CA	3	6	1247650	1247655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_019942	GAG	2	6	1247729	1247734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_019942	GGAT	2	8	1247772	1247779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_019942	CCT	2	6	1247782	1247787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_019942	TAA	2	6	1247861	1247866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_019942	TCCAG	2	10	1256140	1256149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1623	NC_019942	TA	3	6	1256157	1256162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_019942	TTA	2	6	1256166	1256171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_019942	C	8	8	1257576	1257583	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1626	NC_019942	AGG	2	6	1257602	1257607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019942	ATAAAA	2	12	1258779	1258790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_019942	ACC	2	6	1260940	1260945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_019942	GAAA	2	8	1261560	1261567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019942	TAA	2	6	1261571	1261576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_019942	CAA	2	6	1261583	1261588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_019942	TTA	2	6	1263156	1263161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_019942	AAT	2	6	1263216	1263221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.